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| 序号 | 名称 | 依托单位 | 负责人 | 始建时间 |
| 1 | 卵成熟障碍综合诊治研究创新单元 | 北京大学第三医院 | 乔 杰 | 2018年 |
| 2 | 小儿遗传相关性心血管疾病早期防控创新单元 | 复旦大学附属儿科医院 | 严卫丽 黄国英 | 2018年 |
| 3 | 内镜下鼻颅底肿瘤外科治疗技术创新单元 | 复旦大学附属眼耳鼻喉科医院 | 余洪猛 | 2018年 |
| 4 | 口腔黏膜癌变与防治创新单元 | 四川大学华西口腔医院 | 陈谦明 | 2018年 |
| 5 | 眼组织发育和再生医学创新单元 | 中山大学眼科中心 | 何明光 刘奕志 | 2018年 |
| 6 | 情感认知障碍综合诊疗关键技术创新单元 | 北京大学第六医院 | 陆 林 | 2018年 |
| 7 | 脑损伤后上下肢协同重建技术创新单元 | 复旦大学附属华山医院 | 徐文东 顾玉东 | 2018年 |
| 8 | 显微与内镜结合颅底外科技术创新单元 | 复旦大学附属华山医院 | 毛 颖 周良辅 | 2018年 |
| 9 | 新发再发病毒适应进化及其防控应用创新单元 | 中国疾病预防控制中心 | 高 福 | 2018年 |
| 10 | 未知细菌发现和功能研究创新单元 | 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所 | 徐建国 | 2018年 |
| 11 | 精神放射影像创新单元 | 四川大学华西医院 | 龚启勇 | 2018年 |
| 12 | 围术期应激风险评估与临床决策创新单元 | 四川大学华西医院 | 朱 涛 刘 进 | 2018年 |
| 13 | 细胞代谢监测成像新技术创新单元 | 华东理工大学 | 赵玉政 | 2019年 |
| 14 | 多模态跨尺度神经信号检测与成像创新单元 | 华中科技大学苏州脑空间信息研究院 | 骆清铭 | 2019年 |
| 15 | 医学神经生物学创新单元 | 中国脑计划北京市脑科学与类脑研究中心 | 罗敏敏 饶 毅 | 2019年 |
| 16 | 虚拟人体和虚拟手术技术创新单元 | 北京航空航天大学 | 郝爱民 赵沁平 | 2019年 |
| 17 | 基于蛋白组学的药物研发新技术创新单元 | 军事科学院军事医学研究院生命组学研究所 | 徐 平 | 2019年 |
| 18 | 纳米材料与技术创新单元 | 国家纳米科学中心 | 赵宇亮 | 2019年 |
| 19 | 个性化呼吸慢病管理创新单元 | 中国科学院空天信息研究院 | 方 震 | 2019年 |
| 20 | 药物代谢新技术创新单元 | 天津药物研究院有限公司 | 司端运 | 2019年 |
| 21 | 细胞生长因子与疾病研究及临床转化创新单元 | 温州医科大学 | 李校堃 | 2019年 |
| 22 | 脑肿瘤精准诊疗与转化医学创新单元 | 首都医科大学天坛医院 | 江 涛 赵继宗 | 2019年 |
| 23 | 慢性鼻病诊疗创新单元 | 首都医科大学附属北京同仁医院 | 张 罗 | 2019年 |
| 24 | 海岛急救医学创新单元 | 海南医学院 | 吕传柱 | 2019年 |
| 25 | 食品安全创新单元 | 国家食品安全风险评估中心 | 李敬光 吴永宁 | 2019年 |
| 26 | 医用大动物疾病模型构建创新单元 | 中国科学院广州生物医药与健康研究院华南干细胞与再生医学研究所 | 戚华宇 赖良学 | 2019年 |
| 27 | 儿童危重感染诊治创新单元 | 首都医科大学附属北京儿童医院 | 谢正德 | 2019年 |
| 28 | 医学检验创新单元 | 中国医科大学第一附属医院 | 韩晓旭 尚 红 | 2019年 |
| 29 | 脑血管病人工智能研究创新单元 | 首都医科大学附属北京天坛医院 | 赵性泉 王拥军 | 2019年 |
| 30 | 肝胆胰肿瘤综合诊治研究创新单元 | 浙江大学 | 郑树森 | 2019年 |
| 31 | 牙齿发育与再生创新单元 | 首都医科大学 | 范志朋 王松灵 | 2019年 |
| 32 | 感染病（传染病）及微生态创新单元 | 浙江大学 | 肖永红 李兰娟 | 2019年 |
| 33 | 结构疫苗学前沿技术创新单元 | 厦门大学 | 夏宁邵 | 2019年 |
| 34 | 免疫介导肾病诊治创新单元 | 北京大学第一医院 | 张 宏 赵明辉 | 2019年 |
| 35 | 近视的基础和临床防控创新单元 | 温州医科大学附属眼视光医院 | 周翔天 瞿佳 | 2019年 |
| 36 | 常见致盲眼病研究及防治创新单元 | 四川省医学科学院·四川省人民医院 | 杨正林 | 2019年 |
| 37 | 免疫相关性皮肤病诊治关键技术创新单元 | 中南大学湘雅二医院 | 赵 明 陆前进 | 2019年 |
| 38 | 血液恶性疾病诊治关键技术创新单元 | 北京大学人民医院 | 黄晓军 | 2019年 |
| 39 | 肝脏移植与移植免疫创新单元 | 南京医科大学第一附属医院 | 吕 凌 王学浩 | 2019年 |
| 40 | 消化系统肿瘤精准诊治创新单元 | 中山大学肿瘤防治中心 (附属肿瘤医院） | 徐瑞华 | 2019年 |
| 41 | 口腔颌面再生医学创新单元 | 上海交通大学医学院附属第九人民医院 | 张志愿 | 2019年 |
| 42 | 口腔颌面部肿瘤精准病理诊断创新单元 | 北京大学口腔医院 | 李斌斌 李铁军 | 2019年 |
| 43 | 神经信息创新单元 | 电子科技大学 | 尧德中 | 2019年 |
| 44 | 乙肝病毒慢性感染治愈研究创新单元 | 复旦大学 | 袁正宏 | 2019年 |
| 45 | 心血管病和肿瘤大型队列创新单元 | 南京医科大学 | 沈洪兵 | 2019年 |
| 46 | 人兽共患寄生虫致病机制研究创新单元 | 沈阳农业大学 | 姜 宁 陈启军 | 2019年 |
| 47 | 自然疫源性疾病发现与溯源创新单元 | 军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所 | 秦成峰 曹务春 | 2019年 |
| 48 | 肿瘤病理智能分型与精准治疗创新单元 | 浙江大学 | 张红河 来茂德 | 2019年 |
| 49 | 应激与肿瘤创新单元 | 上海交通大学 | 陈国强 | 2019年 |
| 50 | 心律的起源与调控创新单元 | 同济大学附属东方医院 | 陈义汉 | 2019年 |
| 51 | 脑疾病的线粒体机制研究创新单元 | 北京大学分子医学南京转化研究院 | 程和平 | 2019年 |
| 52 | 消化道微生态药理毒理学创新单元 | 河北医科大学 | 丛 斌 | 2019年 |
| 53 | 精准肝胆外科范式创新单元 | 清华大学附属北京清华长庚医院 | 董家鸿 | 2019年 |
| 54 | 情感和情感障碍的脑机制创新单元 | 浙江大学 | 段树民 | 2019年 |
| 55 | 肝癌转移复发防治的基础与临床研究创新单元 | 复旦大学附属中山医院 | 樊 嘉 | 2019年 |
| 56 | 严重创伤救治和组织修复与再生医学创新单元 | 解放军总医院 | 付小兵 | 2019年 |
| 57 | 心血管技术与器械创新单元 | 复旦大学附属中山医院 | 葛均波 | 2019年 |
| 58 | 精准激光医学诊疗创新单元 | 解放军总医院 | 顾 瑛 | 2019年 |
| 59 | 细胞应激研究创新单元 | 厦门大学 | 韩家淮 | 2019年 |
| 60 | 蛋白质组学驱动的肿瘤精准医学创新单元 | 军事科学院军事医学研究院生命组学研究所 | 贺福初 | 2019年 |
| 61 | 胚胎源性疾病研究创新单元 | 上海交通大学医学院附属国际和平妇幼保健院 | 黄荷凤 | 2019年 |
| 62 | 道地药材研究创新单元 | 中国中医科学院中药研究所 | 黄璐琦 | 2019年 |
| 63 | 皮肤及皮肤病群体遗传学和防控新技术研究创新单元 | 复旦大学 | 金 力 王久存 | 2019年 |
| 64 | 人兽共患病毒病防控关键技术研究创新单元 | 军事科学院军事医学研究院军事兽医研究所 | 金宁一 | 2019年 |
| 65 | 代谢性疾病的临床和基础研究创新单元 | 上海交通大学医学院附属瑞金医院 | 宁 光 | 2019年 |
| 66 | 天然免疫与炎性疾病创新单元 | 武汉大学 | 舒红兵 | 2019年 |
| 67 | NK细胞研究创新单元 | 中国科学技术大学 | 田志刚 | 2019年 |
| 68 | 多肽研究创新单元 | 兰州大学 | 王 锐 | 2019年 |
| 69 | 基因与免疫治疗创新单元 | 四川大学华西医院 | 魏于全 | 2019年 |
| 70 | 烧伤暨烧创复合伤救治关键技术创新单元 | 解放军海军军医大学第一附属医院(上海长海医院) | 夏照帆 | 2019年 |
| 71 | 肿瘤的表观遗传学病理研究创新单元 | 复旦大学 | 徐国良 | 2019年 |
| 72 | 寒地慢病研究创新单元 | 哈尔滨医科大学 | 杨宝峰 | 2019年 |
| 73 | 放射肿瘤学创新单元 | 山东省肿瘤医院 | 于金明 | 2019年 |
| 74 | 新型药物先导分子发现创新单元 | 中国科学院上海药物研究所 | 岳建民 | 2019年 |
| 75 | 恶性肿瘤发生发展分子机制研究创新单元 | 北京市肿瘤防治研究所（北京大学肿瘤医院） | 詹启敏 | 2019年 |
| 76 | 疼痛医学研究创新单元 | 上海脑科学与类脑研究中心 | 张 旭 | 2019年 |
| 77 | 细胞焦亡与炎症反应创新单元 | 北京生命科学研究所 | 邵 峰 | 2019年 |
